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L'apport en nutriments, la croissance et le rendement des prairies et des cultures arables sont influencés positivement par une fertilisation correcte avec du lisier acidifié. De plus, le lisier acidifié présente l'avantage qu'en raison de sa meilleure absorption par les plantes – générée par l'interaction du sulfate de soufre – les quantités d'azote hydrosoluble et de phosphore hydrosoluble dans les eaux d'infiltration diminuent. L'ammonium est une forme d'azote chargée positivement. En conséquence, l'ammonium est bien lié aux particules du sol et ne peut donc pas être lavé et pénétré dans les eaux souterraines. On peut donc dire à juste titre que l'eutrophisation de certains plans d'eau et lacs – avec la fertilisation de lisier acidifié – pourrait être réduite. L'absorption de sulfate de soufre par les plantes est parallèle à l'absorption d'azote.

L'acide introduit dans le sol est tamponné par celui-ci et peut – ne pas nécessairement – entraîner une légère diminution de la capacité de neutralisation d’acide (CNA) du sol. Cette capacité serait essentiellement causée par une surfertilisation en S à long terme et est donc principalement influencée par des facteurs spécifiques au site de l'exploitation, la capacité tampon du sol et l'ensemble de la stratégie de fertilisation de l'exploitation elle-même. La fertilisation avec du lisier acidifié à l’H₂SO₄ doit être adaptée aux sols et aux besoins en S des cultures respectives et a tendance à nécessiter des engrais minéraux supplémentaires sans S. C'est une autre façon d'obtenir un solde CNA positif dans nos sols. Les pertes de CNA, qui seraient causées par une sur-fertilisation en soufre, pourraient être compensées par un chaulage (environ 3 kg CaCO³ par kg S*[0,065 kmol]).

L'acidification du lisier conduit à la dissolution des phosphates tels que la struvite et les carbonates, réduisant les dépôts de P, Ca et Mg. De plus, l'acide fournit au sol des ions hydrogène supplémentaires facilement solubles (H⁺) et d'autres acides faibles sont protomés. Les nutriments contenus dans le lisier traité sont donc dans un rapport équilibré les uns par rapport aux autres. Le sol a donc une capacité d'échange de cations (CEC) plus élevée et une capacité d'échange d'anions (CEA) plus faible, ce qui conduit finalement à un sol sain à long terme qui peut fonctionner mieux et plus efficacement.

Il convient de rappeler que le lisier acidifié a des effets positifs sur la disponibilité de la plante des éléments N^tot, P, K, Ca, Mg et SO₄ (appelés «quatrième macroélément»), car ceux-ci augmentent après que le lisier traité a été appliqué. Le risque de lessivage des éléments mentionnés est faible et purement dépendant de la pluie. Faible car le lisier acidifié a une minéralisation accrue en N et il est épandu de la même manière que les conditions météorologiques pour la fertilisation foliaire et non, comme d'habitude, peu de temps avant les précipitations. De plus, les doses de lisier acidifié doivent être adaptées à la croissance des plantes et à leur demande en S, ce qui est généralement plus le cas au printemps qu'en automne.

Il faut également tenir compte du fait que le pH de nos sols n'est pas influencé à long terme par le lisier acidifié (ni en bas ni en haut) et qu'après un maximum de 70 jours après l'application du lisier acidifié, cette valeur revient à son niveau comme avant l'application. La consommation de chaux ne pourra donc pas augmenter avec l’utilisation de lisier acidifié. Cette constatation est clairement soulignée par le fait que l'acidité du sol ne change ni dans la mesure de la valeur normale du pH – c'est-à-dire dans une suspension aqueuse (pH) – ni dans la mesure de la valeur du pH dans des conditions naturelles – c'est-à-dire avec un échange de chlorure de potassium cations (pH^KCl).